灵芝属的担孢子皆呈卵圆形，外层细胞壁较薄且透明，内层细胞壁较厚呈黄褐色并有「疣状凸起」。由此可知，是否为灵芝属的必要条件在於「卵形」、「双层细胞壁」、「黄褐色」的担孢子，而并非以菇体（子实体）的外观形状或颜色等可以加以区其他。

  古代「六芝」或许对应的现代学名

以现代菌类分类系统为基础，参照古籍中所谓六芝的记载，经我国科学院微生物研讨所、我国灵芝分类专家赵继鼎先生考证，认为六芝的学名应该如下：

（一）赤芝：时珍曰「赤芝又名丹芝，生霍山。气味苦平无毒，主治胸中结，益心气……。」一般所说的灵芝〔G. lucidum（W.Cust.:Fr.）Karst.〕为此类的代表种，首要特徵是菌伞肾形、半圆形或近圆形，表面红褐色有漆样光泽，有菌柄与菌伞同色或较深。

（二）紫芝：时珍曰「紫芝又名木芝。甘温无毒，主治耳聋，利关节，益精气，坚筋骨，好颜色，疗虚劳，治痔。」紫芝的特徵是菌伞褐色、紫黑色至近黑色，菌肉为均匀褐色至粟褐色，其担孢子较一般赤芝为大，我国紫芝（G. sinense Zhao, Xu et Zhang）为此类的代表种。 

（三）黄芝：时珍曰「黄芝又名金芝。甘平无毒，主治心腹五邪，益脾气，安神。」根据葛洪在《抱朴子》中所描绘「肉芝分为赤、白、黑、青、黄五种，黄者如紫金，大者十余斤，小者三四斤」，认为黄芝或许之一是硫黄菌〔Laetiporus sulphureus（Bull.: Fr.）Murr.〕，这种真菌新鲜时菌伞肉质汁，新鲜标本常可达数斤重。 

（四）白芝：时珍曰「白芝又名玉芝。辛平无毒，主治咳逆上气，益肺气，通利口鼻，强志意，安魄。」《抱朴子》中描绘白芝如「截肪」，因此苦白蹄〔Fomitopsis officinalis（Vill.: Fr.）Bond. et Sing.〕或许为此类。这种真菌菌肉质白，如马蹄状，大者可数斤，生於松树和其他针叶树上。

（五）黑芝：时珍曰「黑芝又名玄芝。咸平无毒，主治癃，利水道，益肾气，通九窍，聪察。」依《采芝图》记载，黑芝生山谷之阴，黑盖赤理，黑茎，味咸苦。根据以上记载，黑芝或许是假芝〔Amauroderma rugosum（Bl.et Nees）Tarrend〕和黑柄孔菌（Polyporus melanopus Fr.）这类具有黑色菌伞和菌柄的真菌。

（六）青芝：时珍曰「青芝又名龙芝。酸平无毒，主治明目，补肝气，安精魄。」《抱朴子》云「青者如翠羽」，认为云芝〔Coriolus versicolor（L.: Fr.）Quel.〕或许是青芝的代表，此种真菌亦具革质菌盖，表面有短绒毛，因此富样颜色改动。 

其他由古籍中六芝记载的分布来分析，赤芝、紫芝、黑芝产於衡山、高夏山、常山，属於长江流域；而黄芝、白芝、青芝生於嵩山、华山、泰山，属於黄河流域，真菌生态习性与分布区域有接近的联系。

再者六芝所指皆非为单一种类，而是六类团体。以赤芝而言，常见的「赤色」灵芝有 G. lucidum 和 G. tsugae 两种；紫芝则为 G. neo-japonicum 和 G. sinense。现在有关培育、药理、临床等的研讨亦仅以此两大类灵芝为主，换言之，除赤芝、紫芝外，其他黄、白、青、黑各色灵芝的分类方位与药理研讨陈述，现在皆尚未被正式宣告。